Una dintre cele mai mari aprinse discuții în contradictoriu este legată de folosirea Bibliei ca document istoric. Există, însă, și alte controverse, pe care noi vi le vom prezenta aici:
Soția lui Dumnezeu
Există unii arheologi și istorici care, bazându-se pe informații obținute în teren, susțin că Dumnezeu avea o soție, pe nume Asherah. Raphael Patai, istoricul care a venit cu această teorie, în anul 1967, credea că cele două entități divine erau la fel de importante pentru vehii locuitori ai Israelului. În anul 2012, cercetătoarea Franceska Stavrakopoulou restabilea această ipoteză, afirmând că în situl de la Kuntillet Ajrud, în Deșertul Sinai, au fost descoperite fragmente ceramice inscripționate cu cereri de binecuvântare adresate ,,lui Yahwev și a lui Asherah”. Artefactele au fost datate în secolul VIII î.Hr.
Locul Judecății lui Iisus
Deși este una dintre cele mai importante scene descrise în Biblie, arheologii nu au reușit până acum să se pună de acord în privința locului în care a avut loc procesul în care a fost judecat Iisus. În timpul lucrărilor de extindere a turnului Muzeului lui David din Ierusalim, în anul 1999, cercetătorii credeau că au descoperit sistemul de canalizare și fundațiile zidurilor palatului regelui Irod cel Mare. Există voci care susțin că, aici, Iisus a fost judecat înainte de a fi crucificat. În Evangheliile din Noul Testament apar informații contradictorii referitoare la această locație, însă în Evanghelia după Ioan se menționează că judecata a avut loc într-o încăpere care ar corespunde uneia descoperite în celebrul palat al lui Irod.
Erorile din Noul Testament
,,Forged”, o carte publicată de istoricul Bart Ehrman în anul 2011, a stârnit nenumărate controverse încă de la apariția sa. Cercetătorul american susține în volumul său că aproape jumătate din informațiile prezentate în Noul Testament au fost falsificate de autori care făceau propagandă religioasă. Ehrman este de părere că falsificatorii ar fi mințit pentru ceea ce ei credeau că este binele suprem. Mai mult decât atât, Evangheliile ar fi fost falsificate pentru a atrage cât mai mulți adepți către religia creștină.
Biblia homosexualilor
În anul 2012, un grup anonim publica așa-numita ,,Queen James Bible” sau ,,Biblia homosexualilor”, în care apăreau opt verste din Biblia Anglicană, modificate în așa fel încât cititorii să nu poată interpreta textele sacre într-un mod homofobic. De exemplu, în Levitic 18:22, ei au adăugat cinci cuvinte, pentru a-și susține crezul: ,,Să nu te culci cu bărbați sau cu femei în templul lui Molech, pentru că este o abominație”. Cercetătorii spun că, acum, în verset, este condamnat sexul cu bărbați în temple și nu doar un anumit tip de act sexual.
Exodul și avortul
De-a lungul timpului, au existat numeroase controverse privind însemnătatea versiunii Douay-Rheims a versetelor 22-25, din capitolul 21, din Exod: ,,Dacă se ceartă doi oameni și lovesc o femeie însărcinată și o fac să nască înainte de vreme, fără altă nenorocire, să fie pedepsiți cu o amendă, pusă de bărbatul femeii și pe care o vor plăti după hotărârea judecătorilor. Dar dacă se întâmplă o nenorocire, vei da viață pentru viață, ochi pentru ochi, dinte pentru dinte, mână pentru mână, picior pentru picior, arsură pentru arsură, rană pentru rană, vânătaie pentru vânătaie”.